Desarrollo de herramientas “user-friendly” para el análisis de datos de secuenciación masiva de ADN y la investigación de resistencias a antimicrobianos
- Narciso Quijada
- David Mendoza-Salido
- Alejandro Alcañiz
- Brad Hart
- Carlos Sabater
- David Abad
- Francesco Asnicar
- Jorge Rodríguez-Grande
- José Cobo-Díaz
- Livio Antonielli
- María Dolores de Toro Jordano
- Johanna Rhodes
- Alicia Pageau
- Anna Fijarczyk
- Camille Antonielli
- Christian Landry
- Pablo Salvador Fernández Escámez (coord.)
- Alfredo Palop Gómez (coord.)
- Arturo Esnoz Nicuesa (coord.)
- Silvia Guillén (coord.)
Publisher: Universidad Politécnica de Cartagena
ISBN: 978-84-17853-94-5
Year of publication: 2024
Pages: 93-95
Congress: Congreso Nacional de Microbiología de los Alimentos (23. 2024. Cartagena)
Type: Conference paper
Abstract
En este trabajo presentamos varios software de código de código libre diseñados para el análisis de datos de secuenciación masiva de microbiomas con el objetivo de investigar las resistencias a antimicrobianos (RAM) con una premisa principal: que sean fáciles de usar. TORMES 2.0, transTORMES y torMAGs pueden trabajar directamente desde los archivos crudos de secuenciación y permiten el análisis completo de genomas bacterianos, la recuperación de MAGs de metagenomas y el análisis RNAseq. Respectivamente. ChroQueTas permite el análisis RAM en genomas fúngicos, buscando mutaciones en genes diana de los antifúngicos