Utilización de los algoritmos RMA y SAM en el análisis diferencial de genes en dos estados a partir de datos de microarrays de alta densidad

  1. Alonso López, Diego
  2. Rivas López, María Jesús
  3. Rivas, Javier de las
  4. Sánchez Santos, José Manuel
Libro:
XXX Congreso Nacional de Estadística e Investigación Operativa y de las IV Jornadas de Estadística Pública: actas

Editorial: Comité organizador del XXX Congreso Nacional de Estadística e Investigación Operativa y IV Jornadas de Estadística Pública

ISBN: 978-84-690-7249-3

Año de publicación: 2007

Congreso: Congreso Nacional de Estadística e Investigación Operativa (30. 2007. Valladolid)

Tipo: Aportación congreso

Resumen

Para encontrar genes diferencialmente expresados en dos condiciones biol´ogicas suelen llevarse a cabo experimentos con microarrays que miden la expresi´on del genoma. Esta tecnolog´ýa gen´etica trabaja con grandes cantidades de datos pues se utiliza para medir la expresi´on de todos los genes a la vez. El an´alisis e interpretaci´on correcta de los datos no son tareas triviales y requieren de un protocolo avalado por criterios biol´ogicos y que sea robusto en el aspecto estad ´ýstico. Este protocolo se basa en el c´alculo de la se�nal mediante el algoritmo RMA (Robust Microarray Analysis) y la identificaci´on de genes diferencialmente expresados mediante el algoritmo SAM (Significance Analysis of Microarrays)