Epidemiología clínica y molecular de bacteriemias por Escherichia coli en el Hospital Clínico Universitario Virgen de la Arrixaca

  1. Segura Basail, Javier
Dirigida por:
  1. Genoveva Yagüe Guirao Director/a
  2. Carme Salvador García Director/a

Universidad de defensa: Universidad de Murcia

Fecha de defensa: 07 de noviembre de 2017

Tribunal:
  1. Juan Luis Muñoz Bellido Presidente
  2. C. Guerrero Gómez Secretario/a
  3. Concepción Gimeno Cardona Vocal

Tipo: Tesis

Resumen

OBJETIVOS: El objetivo principal de este estudio fue analizar las características epidemiológicas, clínicas y microbiológicas de las bacteriemias por Escherchia coli en el Hospital Clínico Universitario Virgen de la Arrixaca durante el periodo de un año. MATERIAL Y MÉTODOS: Se recogieron los datos demográficos y epidemiológicos de todos los pacientes con bacteriemia documentada por E. coli durante el año 2013. Se recuperaron y estudiaron los aislados consecutivos de Escherichia coli procedentes de hemocultivos. La identificación bioquímica y sensibilidad antibiótica de los aislamientos se realizó mediante el sistema automatizado Vitek2¿. Se sospechó la presencia de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) en las cepas en las que las concentraciones mínimas inhibitorias para cefotaxima y ceftazidima fueron iguales o superiores a 2 microgr/ml y se confirmaron fenotípicamente mediante el método de sinergia con doble disco de acuerdo con el CLSI. Se realizó la caracterización de las enzimas BLEE, se determinó el grupo filogenético, factores de virulencia, la presencia específica de los clones ST69 ST73, ST95, ST131 y se caracterizaron las ST ("Sequence type") de todos los aislados pertenecientes al filogrupo B2 y productores de BLEE no caracterizados previamente. RESULTADOS: La incidencia de bacteriemias producidas por E. coli fue de 86,5 episodios/100000 habitantes-año. La edad media en adultos fue de 63,9 años y un 72,8% presentaron alguna comorbilidad. El 58,5% de las bacteriemias fueron de tipo comunitario y el 59,5% de foco urinario. Un 9.9% de las cepas de E. coli fueron productoras de BLEEs y la resistencia global a ciprofloxacino fue del 39,6%. Se encontraron mayores resistencias a antibióticos entre los aislamientos de E. coli productor de BLEEs y en cepas resistentes a ciprofloxacino. La existencia de enfermedad pulmonar crónica y la administración de antibioterapia previa fueron factores de riesgo para la adquisición de bacteriemia por E. coli BLEE, observandose una tendencia para la adquisición de bacteriemia por E. coli resistente a ciprofloxacino. El 80% de las BLEEs pertenecían a la familia CTX-M y un 46,7% fueron CTX-M 15. El filogrupo mayoritario fue el B2 (52,9%) seguido del grupo D (13,4%). El porcentaje de cepas ExPEC fue del 69,8% y el factor de virulencia mas prevalente fue iutA. Entre los aislados del filogrupo B2 el complejo clonal mayoritario fue ST95 (15%), seguido de ST73 (12,8%) y ST131(10,7%). ST69 supuso el 67% de aislamientos del filogrupo D. Entre las cepas BLEE un 38,9% pertenecieron al clon ST131 ,asociandose en un 85% a CTX-M 15 y un 11,1% pertenecieron a ST155. Se observaron diferencias estadisticamente significativas en cuanto a la administración previa de antimicrobianos y diabetes mellitus en bacteriemias por cepas No-ST73 y No-ST131, respectivamente. Las STs 69, 73 y 95 fueron en lineas generales más sensibles mientras que las ST131 fueron más resistentes. CONCLUSIONES: En nuestro estudio se observó un predomino de bacteriemias por E. coli de adquisición comunitaria y origen urinario en pacientes de edad avanzada y elevada comorbilidad.La presencia de BLEE y la resistencia a ciprofloxacino se asociaron con mayores tasas de resistencia a otras familias de antibioticos. Los factores de riesgo para la adquisición de bacteriemia por E. coli BLEE fueron antibioterapia previa y enfermedad pulmonar crónica y se observo una tendencia en cepas de E. coli resistentes a ciprofloxcino. Se observó una elevada presencia de microorganismos pertenecientes al grupo filogenético B2 y clasificados como ExPEC. Las ST mayoritarias fueron ST95, ST73, ST131 y ST69 y en cepas BLEE se observó un predominio de ST131 asociadas a CTX-M 15. La administración previa de antimicrobianos y diabetes mellitus fueron factores protectores para la adquisicón de bacteriemias por E. coli ST73 y ST131 respectivamente y ST131 se asoció con mayores tasas de resistencia.