Optimización de metodologías para la detección de Sars-Cov-2 y aplicación a la vigilancia epidemiológica en Ecuador

Resumen

La pandemia a nivel mundial denominada COVID-19 causada por el coronavirus del síndrome respiratorio agudo severo de tipo 2 (SARS-CoV-2) se inició a finales de 2019 en China y; se propagó muy rápidamente a nivel mundial. En el Ecuador, el primer caso de COVID-19 se dio el 28 de febrero de 2020 y los casos fueron incrementando debido al ingreso de personas de países extranjeros donde existía circulación activa produciendo que aparezcan más casos en diferentes ciudades del país. Conociendo que las pandemias son una realidad ineludible para el ser humano, los países de la región pusieron en marcha acciones para enfrentar la COVID-19. Entre estas medidas podemos mencionar los confinamientos estrictos, seguidos de restricciones a la movilidad, desarrollo de actividades de educación y empleos en modalidad virtual, protección social y sistemas sanitarios priorizados; que en algunos casos fueron muy tardíos debido al gran impacto y devastación que trajo consigo la pandemia. Se pudo confirmar que los sistemas de salud no estaban preparados y colapsaron, hubo deficiencia en el diagnóstico y falla en la comunicación interinstitucional, particularmente en países en vías de desarrollo como Ecuador. A pesar de todos estos inconvenientes, diversas instituciones públicas y privadas de investigación realizaron estudios para mejorar el diagnóstico de SARS-CoV-2, y estuvieron involucradas en el diagnóstico de COVID-19 en Ecuador en apoyo a los centros de referencia del Ministerio de Salud. Se desarrollaron diversos estudios destinados a mejorar los protocolos diagnósticos de COVID-19 en Ecuador, así como para evaluar la calidad de diferentes pruebas diagnóstico-disponibles en el mercado (tanto pruebas RT-qPCR como pruebas de antígeno). Pudimos mostrar cómo es posible el desarrollo de protocolos de diagnóstico de infección por SARS-CoV-2 más económicos, lo cual tiene particular relevancia en el contexto de países en vías de desarrollo como Ecuador, donde la escasez de recursos para la contención de la pandemia fue constante. Además, pudimos constatar como muchas pruebas para diagnóstico molecular de infección por SARS-CoV-2 de baja calidad fueron comercializadas en Ecuador, mientras que no disponían de autorización para uso clínico en países desarrollados. Además, nuestro laboratorio en la Universidad de Las Américas estuvo involucrado en diagnóstico de COVID-19 desde abril de 2020, desarrollando una intensa labor de diagnóstico gratuito en comunidades vulnerables de Ecuador. Por lo tanto, pudimos obtener información importante sobre la epidemiología de SARS-CoV-2 en diferentes parroquias desatendidas de las provincias de Esmeraldas, Manabí, Tungurahua, Cotopaxi, Bolívar, Napo, Amazonia y las Islas Galápagos del Ecuador con valores de prevalencia que indican que se dio trasmisión comunitaria de COVID-19 desde los primeros meses de la pandemia en 2020, poniendo de relieve la necesidad de realizar pruebas diagnóstico más allá de los pacientes sintomáticos que acuden a los centros hospitalarios. Además, se analizaron grupos de riesgo como personas que viven en albergues, unidades policiales, trabajadores de funerarias y personal de hospitales confirmando su mayor vulnerabilidad frente a la infección por SARS-CoV-2. Finalmente, también se desarrollaron estudios sobre coinfecciones con otros patógenos respiratorios en pacientes de hospitales y ambulatorios en Ecuador. Las publicaciones derivadas de esta tesis doctoral pueden servir como referente para el manejo adecuado de futuras pandemias, poniendo énfasis en la necesidad de garantizar un diagnóstico de calidad en todos los países independientemente de su contexto socioeconómico. Además, nuestros resultados ponen de relieve la necesidad de una masificación del diagnóstico incluyendo a población no hospitalaria para el control de futuras pandemias causadas por agentes patógenos cuya infección puede cursar sin el desarrollo de síntomas.